据警方初步调查，四名17岁男生涉嫌对同校一名15岁女生实施性侵。10月13日，马来西亚教育总监莫哈末阿占宣布开除四名涉案学生，但随后的一则“补充说明”中，这些涉嫌重罪的学生，依然被允许参加即将到来的马来西亚教育文凭（SPM）考试，舆论再次哗然。马来西亚教育部长法德丽娜更是明确表示，“学生的受教育权利必须得到维护”。
一边是涉嫌严重刑事犯罪的施暴者，一边是涉案学生的受教育权，马来西亚教育系统的选择引发了深刻的社会质疑。
马来西亚当地媒体报道截图
10月2日下午2时50分，亚罗牙也县一所中学的三楼教室，15岁的女学生因折返取回遗忘的作业，察觉两名17岁的高年级男生正从门缝中窥视。她试图抽身离开，却已来不及逃脱。
“第一名嫌疑人猛地抓住她的手臂，捂住她的嘴，强行将她推回教室。”马来西亚《阳光日报》援引该案件消息人士透露，这场侵犯并非临时起意，而是一次分工明确的集体作案：一人把守楼梯，两人在教室内施暴，另一人则冷静拿着手机，进行记录。整个过程，如同执行一场冷酷的“任务”。
更令人心寒的是，施暴者还将作案视频上传至网络。这段影像迅速在学生间流传，最终一名看到视频的学生向老师报告，事情才得以揭露。
10月10日，受害者母亲在看到视频后，前往亚罗牙也县警察局报案。受害者随后被转移到马六甲医院，接受身体检查与心理辅导。同日，四名男生被逮捕，警方依据《刑事法典》展开调查。
10月16日，两名17岁被告被押至亚罗牙也法庭。两人皆在律师及家人陪同下出庭，一名被告的父亲是公务员，另外一名被告的父母已离异，只有母亲到场。两名被告分别面临三项重罪指控：共同强奸15岁儿童，触犯《刑事法典》第375B条文，可判处10至30年监禁；违反自然性行为罪，触犯《刑事法典》第377B条文，最高可判20年监禁及鞭刑；依据2017年《儿童性侵罪法令》第14（a）条文的身体性侵犯罪，同样面临最高20年监禁与鞭刑。
然而法庭上，两名被告呈现出截然不同的态度：一人对三项指控全部认罪，另一位被告则完全否认罪行。
但就在“马六甲校园轮奸案”审理期间，吉打州华玲县一所中学再度传出类似案件：一名少女遭轮奸，四名青少年被捕，其中三人为在校学生。